肛门内刺痛一下一下的（阵发性刺痛）症状，可能和肛周脓肿、肛窦炎、肛瘘等病情相关，需要明确病因后，再进行后续治疗。
由于各种原因导致脓肿病变形成，如果脓肿靠近肛管、肛门区域。由于脓肿病变区域张力升高，可能出现阵发性刺痛症状，部分患者出现脓肿破溃，可有流脓表现。确诊病情后，以手术治疗为主，通过切开引流术清除脓液，结合抗生素药物抗炎治疗。
和患者大便干燥等排便异常情况相关，和肛窦的特殊解剖特性相关。由于肛窦开口向上，粪便等污物进入肛窦内，细菌不断繁殖，就可能诱发肛窦炎发生。患者可能出现肛门内部阵发性刺痛症状，多伴随便血、肛门内部瘙痒症状，以保守治疗为主，使用1:5000浓度的稀释高锰酸钾溶液坐浴治疗，然后肛入甲硝唑栓剂等药物，改善局部炎症，如果形成局部脓肿，可手术切开引流。
病变基础在肛瘘瘘管形成，导致肛管、肠管与肛旁组织之间形成异常通道。如果肛瘘内口位于肛管、肛门附近，局部炎症刺激，就可能导致阵发性刺痛症状的发生。目前，手术是治愈肛瘘的唯一途径，需要患者及早就医手术治疗。手术原则在于清除肛瘘瘘管，以及肛瘘内口，结合抗生素药物治疗。
