产前亲子鉴定可以通过绒毛穿刺或者羊水穿刺等方式提取胎儿DNA。
怀孕10周以后，胚胎逐渐发生长为胎儿，通过绒毛穿刺可以提取胎儿DNA片段进行检测。怀孕10周以后，羊水逐渐形成，至怀孕16周后通过羊水穿刺也可以提取胎儿DNA进行检测。通过提取胎儿的DNA检测做亲子鉴定，准确率相对较高。
绒毛穿刺或者羊水穿刺均属于有创检查，操作过程中有可能会引起宫内感染、流产等风险。通常需要在B超引导下操作，取出胎儿DNA后进行检查。操作后密切监测胎心胎动情况，观察腹痛及阴道出血情况，有异常需要积极给予抗炎、保胎等处理。
产前亲子鉴定也可以抽取母体静脉血检测，但准确率相对较低，通过抽取母体静脉血选择胎儿DNA片段，与父亲样本进行检测即可。如果不能明确，仍然需要进一步行绒毛穿刺或者羊水穿刺检查明确。
