打完第三针疫苗后头疼的厉害，其原因要做如下分析与处理：
- 如果患者是在接种疫苗后当天出现头疼，既往没有心脑血管疾病病史，首先考虑是与疫苗接种有关，如：过敏反应、发热反应等。可以先对症处理，使用止痛药物，使患者头痛症状减轻，注意监测血压和体温情况。
- 原有基础疾病，如：高血压病、脑血管畸形等，有可能是由于过度担心疫苗接种反应而焦虑、紧张等，突发血压升高等引起的头痛。如果患者有血压升高，可以根据患者血压增高的幅度，使用降压利尿药物口服或注射治疗，如：贝那普利、螺内酯或呋塞米，也可以加上活血止痛胶囊口服。
- 接种疫苗后出现发热反应，发热时由于脑细胞耗氧量增加，可使患者出现脑缺氧、血管痉挛而导致供血不足或扩张，使颅内压一过性增高引起头痛。需要监测体温，如果有发热，需要及时进行退热处理，退热后头痛症状可减轻，要注意多喝水。
- 如果持续头痛不缓解，有必要做颅脑CT或磁共振检查，了解有无脑血管疾病。如：脑血管畸形破裂出血或高血压后脑血管破裂出血等，要及时住院诊治。
