睡觉肛门里面疼痛醒了，可能和肛裂、肛窦炎、肛周脓肿等病情相关，需要确诊具体原因后再进行治疗。具体如下：
如果在晚睡前有排便行为，粪便撑开肛裂伤口，可诱发肛门疼痛以及便血症状。睡觉过程中，如果出现肛管括约肌痉挛的情况，则可能会诱发睡觉肛门里面疼痛醒了的表现。暂时可以肛入痔疮膏、口服布洛芬等药物改善疼痛情况。建议患者及早去医院就诊，结合患者病情进行治疗。如果肛裂伤口新鲜，可以采取保守治疗措施，促进伤口愈合。如果病史较长，建议手术切除肛裂伤口，让创面重新愈合恢复。
和肛窦的特殊解剖结构以及大便干燥等情况相关，发病以后，也可能诱发睡觉肛门里面疼痛醒了的症状。确诊病情后，可以肛入甲硝唑栓剂，有较好的消炎作用。结合温水坐浴以及饮食排便习惯调整，可以改善患者病情。对于病情严重的患者，也建议及早手术治疗。
形成肛周脓肿病变之后，睡觉过程中，如果由于身体体位变化，导致脓肿部位受到压迫，可诱发患者出现睡觉肛门里面疼痛醒了的症状。确诊病情后，需要及早手术，将脓肿切开，破坏脓肿、脓腔，清除脓液，结合敏感性抗生素药物抗炎治疗，确保患者治愈。
