支原体感染和细菌感染的不同主要在感染的致病菌、临床表现或治疗上。
支原体感染的致病菌是肺炎支原体，而细菌感染的致病菌可能是多种细菌，比如肺炎链球菌、肺炎克雷伯杆菌、铜绿假单胞菌等。
支原体感染的患者往往会表现为干咳，可能会有乏力、肌肉酸痛的症状，也有可能会有发热的表现，通常表现为低热，而且病人往往不出现呼吸衰竭、休克等严重的并发症。对于细菌性感染的患者来讲，可能会出现咳脓性痰的现象，也有可能会出现发热，病人可能会是低热，也有可能会是高热，细菌感染的患者还有可能合并呼吸衰竭、休克、凝血功能障碍等相关的情况。
支原体感染和细菌感染都需要应用抗生素进行治疗，但是对于支原体感染来讲，常规的抗感染治疗往往是无效的，比如青霉素类的抗生素、头孢类的抗生素，对于支原体感染都没有效果。这种疾病往往需要遵医嘱选择喹诺酮类的抗生素或者大环内酯类的抗生素进行治疗。
平时要注意个人卫生，不使用公共浴巾、泳池等，要在医生的指导下用药。
