乙肝免疫耐受期所能持续的时间比较长，有时候可能会在5年到10年左右，有的甚至在20年左右。
乙型肝炎的免疫耐受期就是病毒携带状态，病毒与机体共存，相互间不会有明显影响，肝功能也无明显损害，生化指标基本正常。由于人体免疫系统尚不完善，因为人体无法识别乙肝病毒，也无法达到清除乙肝病毒的效果，因此最终可能患者会成为慢性乙肝病毒感染。
一般免疫耐受期的患者使用抗病毒的药物很难达到治疗效果，甚至有可能会过早的将患者带入免疫清除期。一般在免疫耐受期的患者只要定期检查，做好医学观察就可以。患者每半年检查一次乙型肝炎病毒的测定、肝功能、肝脾胆超声检查，观察患者肝损伤程度。一旦患者进入到免疫清除期，就可以采用抗病毒治疗。
