阴茎上有疙瘩，可能是尖锐湿疣、生殖器疱疹、珍珠状阴茎丘疹、毛囊炎、皮脂腺囊肿等疾病引起的临床症状。具体如下：
与尖锐湿疣的患者发生了性行为，或者使用了沾染有人乳头瘤病毒的贴身物品被传染上人乳头瘤病毒，引起尖锐湿疣，导致阴茎上长疙瘩。一般都表现为蕈伞状、鸡冠状的疙瘩，表面不光滑。
因为不洁性行为或者其他不良接触方式，感染了单纯疱疹病毒2型，患上生殖器疱疹，使阴茎上长疙瘩。一般都表现为丘疹或者丘疱疹，周围绕有红晕。
包皮过长或个人卫生习惯不好、长期手淫等各种原因引起阴茎珍珠状丘疹，导致阴茎上长疙瘩。表现为珍珠状半透明的小疙瘩，互不融合，没有自觉症状。
阴茎部位的皮肤发生轻微损伤，化脓性细菌侵入到毛囊内引起毛囊炎，导致局部长疙瘩。疙瘩的颜色发红，周围有红晕，可能有疼痛感。
阴茎皮肤上的皮脂腺管口堵塞，分泌物在内部潴留形成皮脂腺囊肿，导致局部长疙瘩。疙瘩表面不光滑，呈灰白色，一般没有疼痛和瘙痒感。
