小孩生殖器长水泡，可能是疱疹病毒感染，也可能是蚊虫叮咬或者药物过敏、细菌感染、摩擦损伤等引起的。具体原因如下：
孩子感染了水痘-带状疱疹病毒引起水痘，水痘的疱疹有可能波及到外生殖器，出现生殖器长水泡；家里面的成年人通过不洁性行为途径感染了生殖器疱疹，使用过的贴身物品上沾染有2型疱疹病毒，被孩子接触后将病毒传染给孩子，使孩子患上生殖器疱疹，引起生殖器上长水泡。
孩子的生殖器上被蚊虫叮咬引起虫咬皮炎，可能在炎性红斑或炎性丘疹的基础上出现长水泡的现象。
孩子服用了磺胺类抗菌药物或者非甾体类消炎镇痛药后引发过敏反应，有可能出现外生殖器部位长水泡的症状。
孩子免疫力低下时，容易被金黄色葡萄球菌侵入到外生殖器部位，引发脓疱疮，导致局部起水泡。
衣服穿的不合适，或者本身患有包皮过长、包茎等疾病，反复摩擦刺激外生殖器，有可能导致局部皮肤下渗出增多，引起水泡。
