睡醒喉咙有痰的常见病因有睡眠打鼾、慢性咽炎、慢性扁桃体炎、慢性喉炎、慢性支气管炎等。
夜间睡眠打鼾、长期张口呼吸，会导致口咽部干燥，引起咽喉部刺激性分泌物，导致睡醒后喉咙有痰。也可伴晨起口干、咽喉异物感，晨起后头疼等症状。
慢性咽炎是咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织的弥漫性慢性炎症性病变。慢性咽炎患者由于咽黏膜充血、黏膜下结缔组织及淋巴组织增生，引起咽部异物感、痒感、灼热感、微痛感。由于咽部慢性炎症刺激，睡醒后可导致患者喉咙有痰的症状。
慢性扁桃体炎多因急性扁桃体炎反复发作所致，由于扁桃体慢性充血、肥大，可有咽内发干、发痒、异物感、刺激性咳嗽等症状。如果扁桃体过度肥大，可影响呼吸，导致张口呼吸，继而造成患者睡醒后喉咙有痰。
慢性喉炎是指喉部慢性非特异性炎症病变，主要症状是声音嘶哑、喉部干燥感、疼痛感。部分患者喉部分泌物较多，容易形成黏痰，也会导致患者睡醒后喉咙有痰。
慢性支气管炎会引起咳嗽、咳痰、气喘等症状，也会导致患者睡醒后喉咙有痰。
