跑步肚子两侧疼通常不能继续跑，因为引起跑步肚子两侧疼的原因比较多，如乳酸堆积、腹内炎症、小肠间质瘤、肠痉挛、电解质紊乱、腹部肌肉痉挛、吸入冷空气等，若已经出现肚子两侧疼，继续跑会导致病情更加严重，而影响身体健康。
通常跑步肚子两侧疼，是因为平时锻炼时腹肌运动量过大，没有做好运动后的放松工作，导致大量乳酸堆积于腹部两侧，在跑步时可引起肌肉震颤，而造成肚子两侧疼痛。此种情况需多注意休息，并对腹部两侧肌肉进行按摩、热敷，有利于促使血液循环，缓解疼痛。
如果通过以上方法处理，肚子两侧疼痛依然没有缓解，或呈现为持续性加重，则需要及时就医，通过腹部彩超、X线片等检查方法，来明确引起跑步肚子两侧疼的原因，给予针对性治疗。
