扁桃体疼痛可以根据具体病因使用物理治疗、食疗、药物治疗以及手术治疗方法进行对症治疗及对因治疗。
扁桃体疼痛如果是因为上火或轻度扁桃体炎引起的，物理治疗方面可以通过冷敷颈部两侧来降低扁桃体神经的敏感度达到止痛效果；食疗方面可以适当的喝一些具有清咽润喉作用的茶饮品，比如金银花茶、胖大海茶、罗汉果茶或蜂蜜、冰糖雪梨水等；
药物治疗方面可以通过含服西瓜霜含片、西地碘含片或喷洒一支黄花喷剂等药物来缓解疼痛，必要时可以按医嘱服用双氯芬酸钠片等解热镇痛类药物进行对症治疗。
患者病情如果是因为吸烟喝酒、饮食不当等因素引发的肺热表现，建议服用清咽润喉的中药制剂进行调理，比如利咽解毒颗粒等；如果检查存在急慢性扁桃体炎，需要按医嘱使用头孢呋辛酯胶囊、青霉素V钾片、琥乙红霉素等广谱抗生素类药物进行抗感染治疗。
必要时需要根据药物敏感试验结果，选择合适的抗生素类药物进行对因治疗；如果扁桃体疼痛症状经检查和扁桃体肉瘤、扁桃体癌或扁桃体淋巴瘤等恶性疾病有关，对因治疗方案主要以手术和放化疗治疗为主。
