传染性非典型肺炎国家传染法定为乙类传染病，但是要按照甲类传染病进行管理。
传染性非典型肺炎虽然属于乙类传染疾病，但是一旦发现以后要及时的上报，按照甲类传染病的管理方式进行管理。我国的传染病主要分甲乙丙三种类型，其中甲类传染病只有霍乱和鼠疫两种疾病，其他大部分常见的疾病都被分在了乙类和丙类传染性疾病中。由于传染性非典型性肺炎的传染性强、传播范围广，对人民群众的健康危害比较大，所以要按照甲类传染病管理。
发现传染性非典型肺炎后，要求发现传染性疾病的医疗机构应于发现病例两小时内将传染病报告卡通过网络报告。没有实行网络直报的责任报告单位应于两小时内，以最快的方式向当地县级疾病预防机构进行报告，还需要在两个小时之内寄出非典型肺炎传染病的报告卡。
传染性非典型肺炎是由冠状病毒感染引起的呼吸道炎症，发病以后会导致严重呼吸困难，并且没有特别好的药物治疗，所以对健康危害比较大，隔离预防感染是最好的治疗方法，所以这种情况下对于非典型性肺炎的管理就非常严格。
