果酸焕肤一般没有后遗症。但部分人群在进行果酸换肤之后，可能会产生过敏反应、灼伤性损害、干燥脱水等副作用。
果酸存在于柑橘类中的柠檬酸、苹果中的苹果酸、葡萄酒中的酒石酸以及甘蔗中提炼的甘醇酸等，但是通常情况下并不精确是哪种果酸为主，所以可能会导致患者出现过敏反应。过敏以皮肤潮红、水肿、渗出、发痒或湿疹甚至溃烂等局部反应为主。但也有少数可有全身反应，如哮喘、喷嚏、会阴水肿等。
灼伤性损伤通常和果酸的浓度有很大关系，由于每个人的皮肤情况不同，因此适合的果酸浓度也会有明显的差异。如果果酸的浓度过高，则会对皮肤造成灼伤，使皮肤产生充血、潮红、水肿、灼痛等临床反应，严重时还有可能会有流水、起鳞屑等临床表现。
果酸换肤之后，由于角质层比较薄，因此容易发生皮肤干燥。对于皮肤角质层特别薄的患者，还有可能会产生皮肤脱水现象，严重者还可表现为皮肤起皮。
