1.禁欲3～7天，精液常规分析3次以上者，精子密度低于2000万而查不出任何病因，可考虑为特发性少精子症。当精子密度≤l×106/ml时，可诊断为严重少精子症。
2.通过询问病史、体格检查及其他实验室辅助检查（遗传学检查、内分泌激素测定、微生物学检查、抗精子抗体、微量元素测定等），大多能发现引起少精子症的病因。精液分析少精子并同时伴有引起少精子的疾病病因时，可诊断为继发性少精子症。
3.根据有尿频、尿急、尿痛以及尿道烧灼样感，以及尿道外口脓性分泌物，尿液检查脓细胞增多，前列腺液检查白细胞大于10/HP，以及尿培养等可确定有生殖系统炎症。
4.免疫学检查可以确定是否存在自身免疫，染色体核型分析可确定是否存在染色体异常。测定血清FSH、LH、T、PRL也是少精子症检查的重要方法，若FSH、LH低于正常，为继发性少精子症，PRL升高为高泌乳素血症引起的少精子症。
男性患上少精子症原因是什么呢?
1.生殖系统炎症感染是造成少精症的主要原因，
2.泌尿系统感染：附属生殖腺的慢性感染，可以影响精液。
3.精索静脉曲张：精索静脉曲张时，使睾丸的局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响睾丸生精功能，但精索静脉曲张程度与精子质量不成比例。
4.自身免疫：如抗精子抗体可影响精子的产生和运送。
5.内分泌异常：男性正常生精功能依赖于下丘脑-垂体-性腺轴功能的正常，其中任何一个环节障碍，都会影响生精功能，其它如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
6.染色体异常：染色体畸变对精子密度、活动率及形态均有严重影响。
7.隐睾：隐睾是影响精液质量的重要原因之一。
8.其它：阴囊温度过高、放射损伤、化学毒品及药物影响均可造成少精子症。