原发性肝癌的发病主要因素是肝硬化，其中酒精性肝炎，以及病毒性肝炎、长期摄入黄曲霉菌等致癌物是发病诱因。
原发性肝癌在我国发病率相对较高，其中大部分是由于乙肝病毒感染所导致的。长期的病毒感染可以导致肝细胞的变性，在修复过程中可能会产生相应的DNA缺失，以及基因水平的突变，从而诱发肝癌。其他的酒精性肝炎以及摄入致癌物质等，均有可能会诱发肝癌。目前（2021年12月）较为明确的致癌物质为黄曲霉菌，这种致癌物主要存在于霉变的粮食中，应当注意加强防范。
原发性肝癌发病原因较为确切，应当做好预防工作，必要的情况下，注射乙肝疫苗。
