先天性不孕需根据引起的原因进行治疗，具体如下：
第一、女性若有先天子宫发育异常，例如先天无子宫、先天性子宫畸形等，可导致女性无法生育。对于子宫畸形，可通过手术治疗提高受孕率，而先天性无子宫无法治疗。
第二、若是先天性输卵管异常导致女性无法受孕，例如先天性输卵管畸形，可通过输卵管整形术让输卵管恢复正常，如果通过治疗仍然无法怀孕，可选择试管婴儿技术辅助生育。
第三、如果是卵子发育异常，或男性由于先天因素导致睾丸发育不良致使女性不孕，可通过药物或手术治疗改善。必要时，也可选择试管婴儿。
