甲状腺功能五项主要包括甲状腺激素：FT3、FT4，和促甲状腺激素、甲状腺球蛋白抗体、甲状腺过氧化物酶抗体。
甲状腺功能可以确诊很多甲状腺疾病，比如甲状腺激素水平升高，促甲状腺激素降低，考虑原发性甲状腺功能亢进症。甲状腺激素水平降低，促甲状腺激素水平升高，考虑原发性甲状腺功能减退症。甲状腺激素以及促甲状腺激素都降低，有可能是垂体功能减退症。甲状腺球蛋白抗体或者过氧化物酶抗体明显升高，考虑桥本甲状腺炎。
甲状腺疾病的确诊，除了依靠甲状腺功能，还需要完善甲状腺超声等检查。
