根据甲状腺炎种类的不同，接受不同的治疗。甲状腺炎分为急性、亚急性和慢性。
急性甲状腺炎多因细菌感染经血行或邻近组织感染蔓延至甲状腺，所以表现为感染的症状，如有明显的发热、寒战，检查白细胞明显增高，需要针对感染给予抗感染治疗，必要时联合外科干预清除感染灶。
亚急性甲状腺炎多与病毒感染相关，并不是感染性疾病，因此并无特效治疗，发病期间主要为对症治疗，缓解患者发热及疼痛等症状，主要是营养支持，注意休息，对症给予解热镇痛、减慢心率的药物治疗，必要时使用糖皮质激素治疗，一般症状可逐渐自行缓解。
慢性炎症一般表现为甲状腺过氧化物酶抗体和（或）甲状腺球蛋白抗体升高的自身免疫性甲状腺炎，如甲状腺功能正常，暂无特殊治疗，一般需要适碘饮食，定期观察甲状腺功能情况。如出现持续甲状腺功能异常，则根据甲功情况对症治疗。
