一般来说，甲减光靠饮食是无法得到有效的治疗。甲减的治疗分为一般治疗和药物治疗。一般治疗是指甲减若合并贫血，可给予铁剂、维生素B类等药物治疗，缺碘者应补充碘剂。药物治疗主要是用药物进行替代治疗，常用甲状腺激素类药物。如果是桥本氏病、甲状腺术后、碘131治疗甲亢后导致的甲减，往往需要长期甚至终身服药。治疗的目标是将血清甲状腺激素水平和促甲状腺激素恢复到正常水平内。甲状腺素补充治疗应在医生的指导下，合理选择药物服用量和服用时间，不可自行加量或者减量，并定期复查甲状腺功能。
