肾结石手术一般可以分为三种。其中创伤最大的为开放性手术，需要将肾脏切开后取石，由于此方法创伤性较大，因此使用率较低，仅建议其他手术治疗失败的患者考虑。目前使用较多的为微创手术，又分为经皮肾镜手术以及输尿管镜手术，其中经皮肾镜取石术一般适用于结石直径超过20毫米的患者，而输尿管镜碎石术创伤性相较而言更小，且恢复较快。患者在进行手术治疗后，可以通过多喝水，以促进结石残渣随尿液排出体外，预防严重的并发症。同时，若是肾结石患者没有并发症，还可考虑进行体外冲击波碎石术治疗，对身体损伤较小。
