支气管镜检查对于肺部的感染性病变、肿瘤性病变以及支气管异物、狭窄等肺部疾病有较大的诊断价值。
例如长期慢性咳嗽咳痰患者，经抗生素治疗效果不佳，可以通过支气管镜从肺的深部取痰液进行培养，明确病原菌，根据病原体针对性使用抗菌药物，有利于更快治愈疾病。
当机体出现肺部结节怀疑是肺部肿瘤的时候，可以通过气管镜取一部分的组织进行活检，直接确定结节的性质，决定是否需要手术治疗。
如患者出现呼吸困难，呛咳等情况，怀疑是气道狭窄或者误吸入异物的时候，只需要通过进入支气管镜即可快速明确，同时也可以直接取出异物等治疗，快速缓解患者症状。
