先天性心脏病是否可以自愈，不能一概而论。少部分先天性心脏病在5岁之前有自愈的机会，比如缺损较小，房间隔缺损在1cm以下、室间隔缺损在4mm以下、动脉导管未闭在5mm以下。但是对于先天性心脏病较严重患儿，如缺损比较严重，自愈的几率会比较低，此类患者应及时采取治疗措施，以免错过最佳的手术时机。
先天性心脏病的发生和多种因素都有关系，比如遗传因素，如果家族当中的直系亲属有明显的心脏病史，其发生心脏病的几率会比其他人要高很多。其次，怀孕期间接触化学制剂、病毒感染、吸食毒品、酗酒，也会导致先天性心脏病的发生几率增加。
