肠镜和胃镜所带来的痛苦并不能相提而论，这两种检查方式都可以进行无痛操作，主要是在麻醉状态下进行。如果只是做普通的胃、肠镜检查，则会给检查者带来一定的不适感，但是多数人群仍然能配合医生完成检查。
胃镜主要经过咽喉部进入胃内而做的一项检查，在操作的过程当中更容易产生牵拉感，检查者也会产生明显的恶心不适症状。肠镜检查主要是从肛门进入肠腔做的检查，检查过程中可能会伴随腹部疼痛、腹胀等不适感。
对于疼痛比较敏感的人群，可以选择无痛胃镜或者无痛肠镜的方式进行检查。
