药物性肾损害的严重程度与药物的毒力程度、药物的剂量和疗程、患者的肾脏情况有关系。
药物毒力程度是最常见的药物性肾损害的原因，例如氨基糖甙类药物，毒力程度因素与分子氨基酸组基数有关系，链霉素只有两个氨基酸组，毒性最轻，新霉素含有6个氨基酸组，毒性是最强。药物在一定的剂量范围内使用才有治疗的效果，一旦超过治疗剂量，药物就会变成毒物，引起肾脏的损害，原则上使用药物的剂量越大，时间越久，肾脏的损害就会越大。
药物性肾损害除了药物因素以外，还和患者本身的体质及肾脏功能状态有关系，年老患者、肾脏本身有疾病的患者肾损害比一般人要严重。
