乳腺癌的免疫组化指标比较多，临床上常用和有意义的指标有ER、PR、HER2、Ki-67、PS2等。不同的指标，意义是不一样的，各种指标对临床的治疗和预后都有很好的参考价值。
ER和PR如果阳性，一般提示需要行内分泌治疗，相对于ER、PR阴性的乳腺癌来说，预后较好。HER2阳性如果2个加号，需要行FISH检测，FISH检测阳性，提示需要行靶向治疗，病人多预后不佳，肿瘤的侵袭性高，容易复发和转移，对内分泌和化学治疗不敏感。Ki67如果表达率高，说明肿瘤的增殖活性强，所以治疗后容易复发和转移，预后差。
