扁桃体在切除之后，对于成人几乎无不良影响，虽然扁桃体为免疫器官，但成人之后及免疫功能不占重要地位，因此在必要时可行扁桃体切除术。若为幼小的儿童，例如在五岁之前，扁桃体具有非常活跃的免疫功能，因此对于较小的儿童应当严格掌握扁桃体切除的手术适应症，以免影响其生长发育。从解剖上分析咽部淋巴结组织形成两个环，扁桃体属于内环免疫系统的一个器官，在成人之后切除扁桃体后，其他的淋巴组织可代替其功能。如果扁桃体反复发炎，不仅会危害人体的健康，还有可能会引起身体其他的疾病，例如可导致风湿性心脏病、肾炎等。
