变异性咳嗽并不能自愈，甚至无法完全治愈。变异性咳嗽又称为咳嗽变异性哮喘，属于支气管哮喘的一种特殊类型，其本质仍是哮喘，故不能自愈，也无法完全治愈，只能通过药物控制病情。哮喘是一种气道的慢性炎症性疾病，其气道炎症持续存在于疾病的整个过程，故目前尚无法完全根治，变异性咳嗽的本质仍是哮喘，所以无法完全治愈，但通过规范化治疗后，儿童患者临床控制率可达95%，成人可达80%，预后较好。但如治疗不规范导致反复急性发作，或少数难治性哮喘气道炎症持续控制不佳，可导致不可逆性气道重构，可并发肺源性心脏病。
