目前据统计不育症患者中，合并染色体异常的发生率约占5%，有常染色体异常：如平衡易位携带者染色体的缺失到位和染色体的多态性，这些是可以做试管婴儿的，而且还有性染色体异常，性染色体异常。像克氏症，克氏症是可以做但是患者往往没有精子比较困难，还有女性45XO这个是不可以做试管婴儿的，还有二十一三体也是不可以做试管婴儿。
还有一种染色体异常像罗氏易位，这种做试管婴儿需要做第三代试管婴儿，通过第三代试管婴儿挑出正常的胚胎来进行移植。
