慢性胰腺炎最主要的表现是消化不良，消化能力下降、消化酶的缺失或减少，有消化不良症状。还有腹泻，临床叫脂肪泻，是在稀薄大便里经常见到有油滴，而且由于对蛋白的消化不好，大便气味比较大。再一个疼痛，在有些慢性胰腺炎比较多见，是由于慢性胰腺炎、急性重症胰腺炎遗留下来，造成胰腺的组织结构改变，可有局部的神经损害，疼痛比较顽固。
还有胰腺假性囊肿吸收不完全，小的囊肿一般没症状，如果囊肿比较大，病人会有肚胀和疼痛。如果有糖尿病，还有表现糖尿病的相关症状。通常将腹痛、体重下降、糖尿病、脂肪泻称为慢性胰腺炎的四联征。
