胃肠镜本身是没有冲突的，可以一起做，但是用两条不同的镜子，肠镜比胃镜要长一些。正常情况下，做胃镜时需要空腹才可以检查，检查当天不能进食。而做肠镜检查需要肠道准备，也就是所说的清肠，需要喝泻药，同时喝足3000ml水，以促使肠腔内的大便能顺利排出体外。在检查当天一般是先做胃镜，因为胃镜检查用的时间相对短一些，然后再行肠镜检查，因为肠道相对长，生理弯曲多，耗时多。胃肠镜可以一起做，检查之前医生也会详细询问病史，如果患者情况比较特殊，需要专业医生评判之后予以安排。
