甲状腺手术并发症主要有：出血、感染、心肺相关器官功能障碍的并发症。还有可能出现一些特殊的并发症，包括喉头水肿导致的血肿、窒息等。甲状腺周围有丰富的神经，如果术中伤及喉上神经和喉返神经，可能出现声音嘶哑、饮水呛咳等情况；如果伤及甲状旁腺，可出现手足抽搐、麻木等。少见并发症有气胸，气胸为颈部手术导致的胸膜破裂引起的。如颈部交感神经链损伤、三叉神经损伤可引起Horner综合征，导致患者出现伸舌偏斜、口角歪斜等。
