萎缩性胃炎在临床上会出现非特异性消化不良的症状，例如上腹部疼痛、腹胀、餐后饱胀感、食欲减退、嗳气、反酸、恶心、消瘦、乏力、健忘等。若长期存在这些症状，还会诱发患者出现焦虑、抑郁等精神症状。当患者出现胃部糜烂时，而胃部黏膜长期少量的出血会导致缺铁性贫血，会诱发出现面色苍白、头晕、乏力。若出现自身免疫性胃炎，由于身体对维生素B12吸收不良，会导致出现恶性贫血和神经系统症状，有全身疲软、轻微黄疸、肢体麻木的症状表现。
