区别包茎、包皮过长和隐匿阴茎的方法如下：
包茎指包皮的口径过小，无法翻转，容易引发嵌顿等症状。而包皮过长，指包皮覆盖尿道口，但能上翻，能够露出尿道口和阴茎头。一般包茎会伴随着包皮过长，因此在确诊了包茎的情况下，主要考虑包皮口径狭窄问题。
隐匿阴茎大多见于男性孩童时期，由于男性包皮过长或肥胖等原因限制阴茎发育，使得阴茎变得细小，而且不易显露。
隐匿阴茎与包茎比较容易混淆，隐匿阴茎比较明显的特征是阴茎显露不良，或者外观看起来较为短小，但阴茎体的发育大多没有问题。隐匿阴茎可进行两指指压试验判断。
