肛周脓肿因为具有复杂性和易感染性，与身体其他地方的脓肿不同，应该在专业的科室进行治疗和就诊。较为严重的患者应就诊肛肠科，症状轻微的患者也可以就诊于普通外科。如果是儿童患者，也可以就诊于儿科或者是小儿外科。
肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓性感染性疾病。肛肠科主要面向肛肠类疾病，如痔疮、肛裂、肛乳头肥大等疾病，在肛肠科专业医生的建议和指导下，才能更好的切开和人工引流，更好的控制感染。
分类不清或者是位置比较高的肛周脓肿可以挂普通外科进行分类鉴别，诊断较为明确的还是应该就诊于肛肠科。
