海绵窦综合征治疗分为手术治疗、介入栓塞治疗、药物治疗，其选择原则主要取决于引起海绵窦综合征的原发病因。
手术治疗主要是通过切除侵袭到海绵窦的肿瘤，彻底解决海绵窦综合征，这是最直接的治疗方法，但手术治疗对患者的基础状况要求较高，同时易带来术后的神经功能障碍等情况。
对于颈内动脉海绵窦瘘等疾病引发的海绵窦综合征，应用介入栓塞是一种高效微创的治疗方式，通过血管内介入，将瘘口予以堵塞，瘘口堵塞后引起的不适症状便会消失。
药物治疗属于辅助治疗，药物治疗的目的主要是抗感染。
