新生儿眼睛斜视的原因主要有生理性因素以及疾病因素。
- 新生儿眼睛斜视最常见的生理性因素主要是新生儿眼部肌肉还没有发育成熟而导致的，眼部肌肉协调相对比较差，如果光源从一个固定的位置以一个固定的角度照射新生儿，宝宝就很容易出现眼睛老往一个方向凝视的情况，时间久了就会引起斜视，因此应该经常变换宝宝躺卧体位，经常练习趴卧抬头，室内光线要柔和，避免一个方向引逗孩子，以免引发斜视。
- 其次，新生儿眼睛斜视还可能是病理性因素导致的，尤其是眼部疾病以及中枢神经系统疾病。其中眼部疾病主要是见于眼外肌肉受到损害而导致的或者是动眼神经损害而导致的。颅内疾病主要是见于颅内出血、颅内占位性疾病以及缺血缺氧性脑病等，一般会有神经系统症状伴随。
