甲状腺功能异常属于内分泌系统方面的疾病，主要是挂内分泌科。
而甲状腺形态异常，如存在结节甚至恶变、出现甲状腺癌的情况，属于外科疾病，根据病变部位、治疗方法的选择，以及各医院分科不同，选择相应外科（如甲状腺外科，头颈外科），有时需要挂核医学科就诊。
甲状腺功能异常和形态异常往往同时存在，所以，当患者需要进行甲状腺检查时，可以都先挂内分泌科。一般情况下在首诊挂内分泌科后，医生会根据患者的症状和体征情况，先为患者开具抽血和超声检查，检查甲状腺的功能情况及甲状腺形态学表现。
如患者仅存在甲状腺功能异常，可继续于内分泌科就诊，在决定了相应治疗手段后，可能需要另到核医学科就诊。
对于甲状腺存在结节的情况，大部分内分泌科医生会根据结节特征，给予患者相应的建议，如考虑存在压迫症状或有恶变可能性，会建议患者前往相应外科就诊。
