多发性硬化和格林巴利综合征的区别主要在受损部位和临床表现上。
多发性硬化和格林巴利综合征都属于神经系统的自身免疫性疾病。但是多发性硬化是发生于中枢神经系统，格林巴利是发生于周围神经和神经根。
多发性硬化有时间上的多发性，可以反复发作。格林巴利综合征大部分人是单向的病程，即只罹患一次。多发性硬化还有空间上的多发性，症状多：头晕、眼震、视力减退，单肢、双下肢、四肢麻木或者瘫痪，也可以是偏瘫或者偏身感觉障碍等等。而格林巴利综合征的肢体瘫痪表现为四肢对称性的无力，一般从肢体远端逐渐向近端进展，累及呼吸肌时会引起急性窒息死亡。
