多系统萎缩的临床症状是根据病变累及部位的不同，而出现不同的表现，大致可以分为小脑共济失调、帕金森综合征、自主神经系统功能障碍、锥体束征等。
多系统萎缩是神经系统变性疾病，病变累及自主神经系统的患者，其可表现为自主神经功能障碍，如性功能障碍、尿频、尿失禁、尿潴留、直立性低血压。
累及脑干、小脑可引起共济失调，表现为走路不稳、说话不清楚、肢体协调能力差，锥体束征阳性等，如橄榄桥小脑萎缩（OPCA）。
病变累及锥体外系，可以表现为帕金森综合征，患者出现运动迟缓、震颤、肌强直，姿势障碍等，如纹状体黑质变性（SND）。多系统萎缩目前无有效的治疗办法。
