甲状腺过氧化物酶抗体过高会损伤甲状腺组织，引起甲状腺功能异常，分泌过多的甲状腺素或是导致甲状腺激素合成和分泌减少。甲状腺过氧化物酶抗体属于人体的一种甲状腺自身抗体，含量过高的情况下会破坏甲状腺过氧化物酶，而甲状腺过氧化物酶又是人体合成甲状腺激素的一种重要物质，因此甲状腺过氧化物酶抗体过高会出现甲状腺激素分泌过少，引起的甲减症状。另外，又因为这种抗体会直接损害甲状腺组织，会使甲状腺滤泡中储存的甲状腺激素释放入血，引起血清甲状腺激素含量过高，导致患者出现甲亢的症状。
