线粒体脑肌病目前还没有特效的能够治愈的方法，主要是通过饮食调节以及药物治疗等方法来缓解症状，减轻患者的痛苦，提高生活质量。在饮食上要注意尽量多吃富含高蛋白、高碳水化合物以及低脂肪的食物，以减少人体内源性的毒性代谢产物产生。药物方面可以采用B族维生素、激素等药物进行对症治疗。另外，如果出现颅压增高、糖尿病等情况，可以使用对应的药物。如果患者出现了重度心脏传导阻滞的情况，可以安装心脏起搏器。如果咽喉部肌肉功能异常，可以手术切除部分肌肉等。
