甲状腺恶性肿瘤的治疗方法主要包括：外科手术治疗、术后放射性碘治疗、甲状腺激素抑制TSH治疗和靶向治疗。
恶性甲状腺肿瘤最多见的是甲状腺癌，少见的有原发性甲状腺淋巴瘤、转移性甲状腺癌（如乳腺癌、肾癌甲状腺转移）。甲状腺癌的首选治疗是手术，手术目的是清除原发灶、清理受累的淋巴结。但即使是甲状腺全切除仍可能会残留部分甲状腺组织，因此碘-131治疗是清除剩余甲状腺组织和残留肿瘤细胞的必要手段。甲癌患者术后还需要给予甲状腺激素治疗，一方面提供机体所需的甲状腺激素，另一方面可以抑制肿瘤复发。另外，近些年已有新型靶向药物研制成功，希望甲癌治疗取得突破。
