单纯肛门息肉手术通常情况下是不痛苦的，因为手术过程中会进行麻醉，因此在手术时不会感觉到疼痛。另外，一般息肉的体积是比较小的，如果通过手术治疗，操作时间比较短，而且创面较小，疼痛也比较轻微。但如果肛门同时有痔疮，手术一并切除了痔疮，术后由于痔疮创面存在，会出现疼痛，特别是排便后撑肛门，疼痛会比较明显。如果不同时切除痔疮，由于息肉手术操作的干扰，也可能导致痔疮发作，出现疼痛。
做完肛门息肉手术后需要保持伤口清洁，大便后要进行清洗，以免出现感染，导致疼痛加重。另外在手术后恢复期间，避免进食辛辣的食物，可以多喝水，适当地进食水果和蔬菜，避免便秘。
