胆囊结石主要是胆固醇结石，所有会影响胆固醇与胆汁酸磷脂浓度比例和会引起胆汁在胆囊内淤积的因素都能导致胆结石，某些情况下还与地区、性别、肥胖、妊娠等因素有关。肝外胆管结石一部分是由于胆囊结石被胆囊收缩挤压入胆管，还有一部分是因为寄生虫或者胆道异物如手术缝线线结等存在会更加容易诱发结石。肝内胆管结石又称肝胆管结石，主要是胆汁淤积、胆道寄生虫如蛔虫、华支睾吸虫等、胆道变异或者患者营养不良等情况导致的。
