孤独症考虑与遗传因素有很大的关系，具体原因还不是特别明确，大部分是在遗传因素、环境因素以及疾病因素等共同作用下而导致的。
孤独症患者大部分存在家族聚集现象，所以家族中如果有孤独症患者，后代发生孤独症的概率相对较高，需要注意观察，必要时需要尽早进行干预处理，尤其是在婴儿时期进行行为干预，可以明显降低疾病的发生概率，而且还可以提高生活质量。
如果环境过于安静或与外界交流过少时，也可能会导致孤独症的发生。
部分患者可能是由心理相关性疾病导致的，甚至是颅内相关疾病。所以孤独症考虑与遗传、环境以及疾病等都是有一定关系的。
