腹腔镜治疗胃食管反流具有一定的风险，但风险大小因人而异。因为患者个人体质、胃食管反流病的病情轻重程度、病因以及手术的难易程度不同，所以患者经腹腔镜治疗后出现并发症的几率以及并发症的轻重程度具有较大的差异。大部分患者经腹腔镜治疗后出现并发症的几率较小。
而有一部分患者经治疗后可能会因为手术过程中折叠缝合过度，引发吞咽困难或者气胀症状，其主要症状表现为进食哽噎感，气胀时不容易出现恶心、嗳气、打嗝症状。患者需要积极去正规医院就诊，根据相关检查结果，权衡手术治疗的利弊后听取医生意见。
