因为胃溃疡和十二指肠溃疡的发病部位和机制不同而导致疼痛性质不同。胃溃疡通常好发于胃窦、小弯侧,而十二指肠溃疡好发于十二指肠球部的前壁。胃溃疡典型的特点是餐后痛,以餐后半小时到一小时,疼痛最为剧烈,而十二指肠溃疡通常为夜间和饥饿的时候疼痛,这是因为食物进入胃内,在胃内停留消化的时间较长,因此对胃壁的刺激时间长而出现了进餐后的疼痛,而当被消化后的食糜进入十二指肠时刺激性较小,因此对十二指肠的刺激较小,疼痛较轻。十二指肠溃疡的患者通常是高胃酸分泌状态,因此夜间和空腹时胃酸分泌,疼痛性质剧烈。