巧克力囊肿不建议进行备孕，多是因为卵巢功能受影响、对输卵管影响、病情比较严重等原因导致的。
1.卵巢功能受影响：巧克力囊肿生长在卵巢部位，会影响到卵巢的功能，进而影响到卵巢的排卵，也会对备孕造成影响。
2.对输卵管影响：巧克力囊肿比较大时，有可能会对输卵管造成压迫，导致输卵管扭曲变形，而输卵管是用来运送精子和受精卵的通道，输卵管变形以后会导致输卵管的功能异常，进而增加异位妊娠的几率，所以也不建议进行备孕。
3.病情比较严重：对于患有巧克力囊肿的患者，如果病情比较严重，有可能会导致囊肿破裂出血，也会刺激到腹膜，引起炎症性反应，从而对卵巢以及输卵管造成影响，也可对怀孕造成影响，所以不建议进行备孕。
对于患有巧克力囊肿的女性，建议及时去医院就诊，进行相应的治疗，并且在治疗期间需要保持良好心态。
